Tak jak w anime i mandze, tak i tutaj jest możliwe przeszczepianie Kekkei Genkai oraz innych Umiejętności.
Oczywiście użytkownicy przeszczepionych umiejętności nie mogą się równać z siłą tych którzy posiadają je od urodzenia(przykładem w anime jest chociażby Yamato), inaczej mówiąc- wszystkie techniki z przeszczepu kosztują o połowię więcej chakry a techniki nie są tak silne jak oryginalne.

Wymagania przeszczepu:
- posiadanie DNA, czyli włosa, paznokcia, naskórka(w przypadku klanu Uchiha i Hyuga oraz Rinnengana, oko)  postaci której umiejętność chcemy pozyskać
- DNA musi być pozyskane w walce fabularnej
- zgoda administracji